現代醫學認為甲狀腺功能減退癥可以由甲狀腺、垂體、下丘腦的功能異常引起。地方性甲狀腺腫是因為飲食中碘不足引起的甲狀腺功能減退。甲狀腺腫是甲狀腺的增生肥大。因為碘缺乏，甲狀腺細胞過度激活增生以便從血液中吸取更多的碘，最后導致甲狀腺增大。母體在妊娠期患自身免疫性甲狀腺疾病，致甲腺發育不良或甲狀腺激素合成障礙也都可導致新生兒甲減的發生。成人甲減最常見原發于甲狀腺本身的損害，主要是由自身免疫性甲狀腺炎（又稱橋本氏病）的后期發展結果所致，是40歲以上女性較多患成人甲減病因。其次因甲亢進行甲狀腺手術或放射性核素治療引起的甲減，偶爾見于甲狀腺痛頸部放射性治療后，急性甲狀腺炎等，除甲狀腺本身疾病外，少數可因垂體或下丘腦病變引起甲狀腺激素合成分泌障礙而發生甲減。 

(一)、甲狀腺發育異常：

常見于甲狀腺缺如或甲狀腺發育不全，甲狀腺異位等。多有家族傾向。

(二)、甲狀腺病變：

由于甲狀腺病變而導致甲狀腺激素分泌不足，主要有：

①甲狀腺炎。以慢性淋巴細胞性甲狀腺炎為主要原因，產生甲狀腺抗體，引起甲狀腺濾泡破壞，最后機化萎縮所致，稱之為特發性甲狀腺功能減退。

②地方性甲狀腺腫。由于缺碘而致甲狀腺激素合成障礙，最終也可以發展成甲狀腺功能減退。

③結節病。約有10%累及甲狀腺，也可致甲狀腺激素合成、分泌不足，引起甲狀腺功能減退。

④甲亢中的自發性甲減。可能系合并自身免疫性甲狀腺炎所致。

(三)、下丘腦病變

某種原因所致下丘腦功能減退而引起促甲狀腺釋放激素減少，最后導致促甲狀腺激素、甲狀腺激素減少。

(四)、垂體前葉功能減退

由于某種原因如產后垂體壞死萎縮、腫瘤壓迫、手術或放射損傷、各種感染及顱內血管病變等引起垂體前葉功能減退，導致促甲狀腺激素及甲狀腺激素分泌減少。臨床常見于席漢氏病及西蒙氏病。

(五)、其它：

如果甲狀腺手術切除過多，放射性碘治療后甲狀腺萎縮以及硫脲類等抗甲狀腺藥物　治療過量而抑制了過氧化物酶，阻礙了甲狀腺激素的合成